Niagalé Bagayoko tiene un doctorado y es politóloga. Su disertación realizada en el Institut d'Etudes Politiques (Science Po) de París recibió el primer premio del Institut des Hautes Etudes de la Défense Nationale francés (IHEDN). Desde entonces, ha realizado una extensa investigación de campo sobre sistemas de seguridad en países africanos francófonos, políticas de seguridad occidentales en África (Francia, Estados Unidos, Unión Europea) y mecanismos africanos de gestión de conflictos, centrándose en la relación entre seguridad y desarrollo. Investigadora en el Institut de Recherche pour le Développement (IRD, por sus siglás en francés) de Francia y luego en el Institute of Development Studies (IDS) de la Universidad de Sussex; también enseñó en Science Po. De 2010 a 2015, dirigió el Programa de mantenimiento y consolidación de la paz en la Organización Internacional de la Francofonía (OIF). Presidenta de la Red Africana del Sector de la Seguridad (ASSN).